Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP27A1Q02318 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms