Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms