Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms