Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms