Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD1P98174 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD1P98174 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD1P98174 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD1P98174 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms