Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMF1P82094 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMF1P82094 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMF1P82094 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMF1P82094 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMF1P82094 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMF1P82094 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TMF1P82094 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMF1P82094 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMF1P82094 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMF1P82094 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMF1P82094 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMF1P82094 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMF1P82094 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMF1P82094 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMF1P82094 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMF1P82094 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMF1P82094 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMF1P82094 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMF1P82094 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMF1P82094 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMF1P82094 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMF1P82094 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms