Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRX6P78412 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRX6P78412 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRX6P78412 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRX6P78412 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX6P78412 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX6P78412 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX6P78412 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX6P78412 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX6P78412 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX6P78412 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX6P78412 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX6P78412 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX6P78412 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX6P78412 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX6P78412 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX6P78412 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX6P78412 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX6P78412 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX6P78412 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX6P78412 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX6P78412 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX6P78412 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX6P78412 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX6P78412 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX6P78412 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX6P78412 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IRX6P78412 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms