Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HBBP68871 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HBBP68871 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HBBP68871 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HBBP68871 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HBBP68871 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HBBP68871 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HBBP68871 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HBBP68871 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HBBP68871 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HBBP68871 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HBBP68871 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HBBP68871 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HBBP68871 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HBBP68871 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HBBP68871 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms