Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL30P62888 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL30P62888 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL30P62888 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms