Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4A1P60842 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms