Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms