Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP107P57740 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP107P57740 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP107P57740 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms