Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms