Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX17P56962 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX17P56962 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX17P56962 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX17P56962 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX17P56962 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STX17P56962 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STX17P56962 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX17P56962 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX17P56962 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX17P56962 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX17P56962 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
STX17P56962 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX17P56962 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX17P56962 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STX17P56962 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX17P56962 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX17P56962 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX17P56962 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX17P56962 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX17P56962 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX17P56962 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX17P56962 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STX17P56962 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX17P56962 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX17P56962 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms