Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSWP56202 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSWP56202 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTSWP56202 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTSWP56202 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTSWP56202 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSWP56202 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSWP56202 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSWP56202 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSWP56202 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSWP56202 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms