Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPTEP56180 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTEP56180 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTEP56180 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms