Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX9P55771 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX9P55771 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX9P55771 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX9P55771 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX9P55771 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX9P55771 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX9P55771 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX9P55771 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX9P55771 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX9P55771 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX9P55771 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX9P55771 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX9P55771 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX9P55771 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX9P55771 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms