Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M2P53677 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms