Protein–RNA interactions for Protein: P53312

LSC2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSC2P53312 SAP185YJL098W 3177 nt2.76□□□□□ -1.97
LSC2P53312 VTC3YPL019C 2508 nt2.76□□□□□ -1.97
LSC2P53312 RPO41YFL036W 4056 nt2.75□□□□□ -1.97
LSC2P53312 UBP1YDL122W 2430 nt2.75□□□□□ -1.97
LSC2P53312 ARP8YOR141C 2646 nt2.75□□□□□ -1.97
LSC2P53312 BFR2YDR299W 1605 nt2.75□□□□□ -1.97
LSC2P53312 FLO11YIR019C 4104 nt2.74□□□□□ -1.97
LSC2P53312 UBP15YMR304W 3693 nt2.74□□□□□ -1.97
LSC2P53312 EAF1YDR359C 2949 nt2.74□□□□□ -1.97
LSC2P53312 TOM1YDR457W 9807 nt2.73□□□□□ -1.97
LSC2P53312 MMS1YPR164W 4224 nt2.73□□□□□ -1.97
LSC2P53312 SLN1YIL147C 3663 nt2.73□□□□□ -1.97
LSC2P53312 SRB8YCR081W 4284 nt2.73□□□□□ -1.97
LSC2P53312 JSN1YJR091C 3276 nt2.73□□□□□ -1.97
LSC2P53312 BIR1YJR089W 2865 nt2.72□□□□□ -1.97
LSC2P53312 MET6YER091C 2304 nt2.71□□□□□ -1.97
LSC2P53312 FIR1YER032W 2631 nt2.71□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YPP1YGR198W 2454 nt2.71□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YJR039WYJR039W 3366 nt2.71□□□□□ -1.98
LSC2P53312 KAP120YPL125W 3099 nt2.71□□□□□ -1.98
LSC2P53312 BNR1YIL159W 4128 nt2.7□□□□□ -1.98
LSC2P53312 MDS3YGL197W 4464 nt2.7□□□□□ -1.98
LSC2P53312 PSK1YAL017W 4071 nt2.7□□□□□ -1.98
LSC2P53312 MRD1YPR112C 2664 nt2.7□□□□□ -1.98
LSC2P53312 CYR1YJL005W 6081 nt2.7□□□□□ -1.98
LSC2P53312 CAF120YNL278W 3183 nt2.7□□□□□ -1.98
LSC2P53312 SAP1YER047C 2694 nt2.7□□□□□ -1.98
LSC2P53312 FYV10YIL097W 1551 nt2.7□□□□□ -1.98
LSC2P53312 RPL37BYDR500C 267 nt2.69□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.69□□□□□ -1.98
LSC2P53312 DCP2YNL118C 2913 nt2.69□□□□□ -1.98
LSC2P53312 CBF2YGR140W 2871 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YER138CYER138C 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YER160CYER160C 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YJR027WYJR027W 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YML039WYML039W 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YML045WYML045W 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YMR050CYMR050C 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 TAH1YCR060W 336 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.68□□□□□ -1.98
LSC2P53312 MSB1YOR188W 3414 nt2.67□□□□□ -1.98
LSC2P53312 INP51YIL002C 2841 nt2.67□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YDR210WYDR210W 228 nt2.67□□□□□ -1.98
LSC2P53312 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.67□□□□□ -1.98
LSC2P53312 SGM1YJR134C 2124 nt2.67□□□□□ -1.98
LSC2P53312 LCL1YPL056C 306 nt2.67□□□□□ -1.98
LSC2P53312 SEC1YDR164C 2175 nt2.66□□□□□ -1.98
LSC2P53312 COX5BYIL111W 456 nt2.66□□□□□ -1.98
LSC2P53312 GLG1YKR058W 1851 nt2.65□□□□□ -1.99
LSC2P53312 FKS3YMR306W 5358 nt2.64□□□□□ -1.99
LSC2P53312 UFD2YDL190C 2886 nt2.64□□□□□ -1.99
LSC2P53312 PKH2YOL100W 3246 nt2.64□□□□□ -1.99
LSC2P53312 RPS26AYGL189C 360 nt2.64□□□□□ -1.99
LSC2P53312 DNA2YHR164C 4569 nt2.64□□□□□ -1.99
LSC2P53312 COG4YPR105C 2586 nt2.64□□□□□ -1.99
LSC2P53312 SGS1YMR190C 4344 nt2.64□□□□□ -1.99
LSC2P53312 IST2YBR086C 2841 nt2.64□□□□□ -1.99
LSC2P53312 MLH3YPL164C 2148 nt2.63□□□□□ -1.99
LSC2P53312 SLH1YGR271W 5904 nt2.63□□□□□ -1.99
LSC2P53312 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt2.63□□□□□ -1.99
LSC2P53312 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt2.63□□□□□ -1.99
LSC2P53312 MSH5YDL154W 2706 nt2.63□□□□□ -1.99
LSC2P53312 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt2.62□□□□□ -1.99
LSC2P53312 YDL206WYDL206W 2289 nt2.62□□□□□ -1.99
LSC2P53312 RTT107YHR154W 3213 nt2.62□□□□□ -1.99
LSC2P53312 MAK10YEL053C 2202 nt2.61□□□□□ -1.99
LSC2P53312 SVL3YPL032C 2478 nt2.61□□□□□ -1.99
LSC2P53312 YDR209CYDR209C 414 nt2.61□□□□□ -1.99
LSC2P53312 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.61□□□□□ -1.99
LSC2P53312 POL5YEL055C 3069 nt2.6□□□□□ -1.99
LSC2P53312 VPS8YAL002W 3825 nt2.6□□□□□ -1.99
LSC2P53312 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.6□□□□□ -1.99
LSC2P53312 NUP157YER105C 4176 nt2.6□□□□□ -1.99
LSC2P53312 snR70snR70 164 nt2.59□□□□□ -1.99
LSC2P53312 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.58□□□□□ -2
LSC2P53312 PDR3YBL005W 2931 nt2.57□□□□□ -2
LSC2P53312 SCP160YJL080C 3669 nt2.57□□□□□ -2
LSC2P53312 snR64snR64 101 nt2.57□□□□□ -2
LSC2P53312 RTP1YMR185W 2946 nt2.57□□□□□ -2
LSC2P53312 YLR232WYLR232W 348 nt2.56□□□□□ -2
LSC2P53312 SLI15YBR156C 2097 nt2.56□□□□□ -2
LSC2P53312 BUB1YGR188C 3066 nt2.55□□□□□ -2
LSC2P53312 NUM1YDR150W 8247 nt2.55□□□□□ -2
LSC2P53312 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.55□□□□□ -2
LSC2P53312 TBS1YBR150C 3285 nt2.55□□□□□ -2
LSC2P53312 ORC3YLL004W 1851 nt2.54□□□□□ -2
LSC2P53312 TOR1YJR066W 7413 nt2.54□□□□□ -2
LSC2P53312 DNF1YER166W 4716 nt2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.6 ms