Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX2P52951 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX2P52951 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX2P52951 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX2P52951 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX2P52951 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX2P52951 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX2P52951 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX2P52951 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBX2P52951 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBX2P52951 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms