Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPC3P51654 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC3P51654 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC3P51654 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms