Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RARRES1P49788 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms