Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS1P48651 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms