Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME1P48163 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME1P48163 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME1P48163 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME1P48163 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME1P48163 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms