Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
XCR1P46094 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
XCR1P46094 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
XCR1P46094 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCR1P46094 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCR1P46094 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms