Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms