Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms