Protein–RNA interactions for Protein: P40422

RPC10, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, yeastyeast

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10P40422 ASE1YOR058C 2658 nt-0.49□□□□□ -2.49
RPC10P40422 SPO21YOL091W 1830 nt-0.5□□□□□ -2.49
RPC10P40422 HTB1YDR224C 396 nt-0.5□□□□□ -2.49
RPC10P40422 YAP6YDR259C 1152 nt-0.5□□□□□ -2.49
RPC10P40422 RPL22BYFL034C-A 369 nt-0.5□□□□□ -2.49
RPC10P40422 POL32YJR043C 1053 nt-0.5□□□□□ -2.49
RPC10P40422 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-0.5□□□□□ -2.49
RPC10P40422 YOR345CYOR345C 351 nt-0.5□□□□□ -2.49
RPC10P40422 SNU56YDR240C 1479 nt-0.5□□□□□ -2.49
RPC10P40422 NIP100YPL174C 2607 nt-0.51□□□□□ -2.49
RPC10P40422 RAD61YDR014W 1944 nt-0.51□□□□□ -2.49
RPC10P40422 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.51□□□□□ -2.49
RPC10P40422 YJL007CYJL007C 315 nt-0.51□□□□□ -2.49
RPC10P40422 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.51□□□□□ -2.49
RPC10P40422 SEC10YLR166C 2616 nt-0.51□□□□□ -2.49
RPC10P40422 NIP1YMR309C 2439 nt-0.52□□□□□ -2.49
RPC10P40422 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.52□□□□□ -2.49
RPC10P40422 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.52□□□□□ -2.49
RPC10P40422 snR46snR46 197 nt-0.52□□□□□ -2.49
RPC10P40422 HAL9YOL089C 3093 nt-0.53□□□□□ -2.49
RPC10P40422 VAM3YOR106W 852 nt-0.53□□□□□ -2.49
RPC10P40422 YOR248WYOR248W 303 nt-0.53□□□□□ -2.49
RPC10P40422 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.53□□□□□ -2.49
RPC10P40422 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.54□□□□□ -2.5
RPC10P40422 HTB2YBL002W 396 nt-0.54□□□□□ -2.5
RPC10P40422 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-0.54□□□□□ -2.5
RPC10P40422 UTP8YGR128C 2142 nt-0.55□□□□□ -2.5
RPC10P40422 URB1YKL014C 5295 nt-0.55□□□□□ -2.5
RPC10P40422 PBI2YNL015W 228 nt-0.56□□□□□ -2.5
RPC10P40422 IRC16YPR038W 360 nt-0.56□□□□□ -2.5
RPC10P40422 RAD34YDR314C 2079 nt-0.57□□□□□ -2.5
RPC10P40422 YPL205CYPL205C 345 nt-0.57□□□□□ -2.5
RPC10P40422 snR34snR34 203 nt-0.57□□□□□ -2.5
RPC10P40422 snR72snR72 98 nt-0.58□□□□□ -2.5
RPC10P40422 SRB7YDR308C 423 nt-0.58□□□□□ -2.5
RPC10P40422 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.58□□□□□ -2.5
RPC10P40422 YIR044CYIR044C 186 nt-0.58□□□□□ -2.5
RPC10P40422 ILM1YJR118C 612 nt-0.58□□□□□ -2.5
RPC10P40422 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.58□□□□□ -2.5
RPC10P40422 YOL160WYOL160W 342 nt-0.58□□□□□ -2.5
RPC10P40422 EMC4YGL231C 573 nt-0.59□□□□□ -2.5
RPC10P40422 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.59□□□□□ -2.5
RPC10P40422 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.59□□□□□ -2.5
RPC10P40422 YML108WYML108W 318 nt-0.59□□□□□ -2.5
RPC10P40422 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.59□□□□□ -2.5
RPC10P40422 YGL015CYGL015C 393 nt-0.6□□□□□ -2.51
RPC10P40422 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.6□□□□□ -2.51
RPC10P40422 YLR171WYLR171W 390 nt-0.6□□□□□ -2.51
RPC10P40422 SVS1YPL163C 783 nt-0.6□□□□□ -2.51
RPC10P40422 UBS1YBR165W 834 nt-0.6□□□□□ -2.51
RPC10P40422 YBR206WYBR206W 324 nt-0.6□□□□□ -2.51
RPC10P40422 DCP1YOL149W 696 nt-0.61□□□□□ -2.51
RPC10P40422 YPL261CYPL261C 309 nt-0.61□□□□□ -2.51
RPC10P40422 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.62□□□□□ -2.51
RPC10P40422 ECL1YGR146C 636 nt-0.63□□□□□ -2.51
RPC10P40422 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.63□□□□□ -2.51
RPC10P40422 YPR096CYPR096C 303 nt-0.63□□□□□ -2.51
RPC10P40422 PTP2YOR208W 2253 nt-0.64□□□□□ -2.51
RPC10P40422 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.65□□□□□ -2.51
RPC10P40422 YGL239CYGL239C 315 nt-0.65□□□□□ -2.51
RPC10P40422 YPL225WYPL225W 441 nt-0.65□□□□□ -2.51
RPC10P40422 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.66□□□□□ -2.52
RPC10P40422 YKL202WYKL202W 582 nt-0.68□□□□□ -2.52
RPC10P40422 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.69□□□□□ -2.52
RPC10P40422 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.69□□□□□ -2.52
RPC10P40422 YNL319WYNL319W 441 nt-0.69□□□□□ -2.52
RPC10P40422 IPP1YBR011C 864 nt-0.69□□□□□ -2.52
RPC10P40422 DIE2YGR227W 1578 nt-0.7□□□□□ -2.52
RPC10P40422 snR5snR5 204 nt-0.7□□□□□ -2.52
RPC10P40422 BUD26YDR241W 288 nt-0.7□□□□□ -2.52
RPC10P40422 YPR039WYPR039W 336 nt-0.7□□□□□ -2.52
RPC10P40422 APQ13YJL075C 417 nt-0.71□□□□□ -2.52
RPC10P40422 YOL029CYOL029C 606 nt-0.71□□□□□ -2.52
RPC10P40422 snR51snR51 107 nt-0.71□□□□□ -2.52
RPC10P40422 YLR217WYLR217W 324 nt-0.72□□□□□ -2.52
RPC10P40422 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.72□□□□□ -2.52
RPC10P40422 YGR228WYGR228W 345 nt-0.73□□□□□ -2.53
RPC10P40422 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.74□□□□□ -2.53
RPC10P40422 SGF11YPL047W 300 nt-0.74□□□□□ -2.53
RPC10P40422 YGR115CYGR115C 780 nt-0.75□□□□□ -2.53
RPC10P40422 BER1YLR412W 825 nt-0.75□□□□□ -2.53
RPC10P40422 YPR092WYPR092W 306 nt-0.75□□□□□ -2.53
RPC10P40422 YCR001WYCR001W 315 nt-0.76□□□□□ -2.53
RPC10P40422 ATG31YDR022C 591 nt-0.76□□□□□ -2.53
RPC10P40422 YCR022CYCR022C 345 nt-0.77□□□□□ -2.53
RPC10P40422 SDH7YDR511W 402 nt-0.77□□□□□ -2.53
RPC10P40422 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.77□□□□□ -2.53
RPC10P40422 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.77□□□□□ -2.53
RPC10P40422 MRPL32YCR003W 552 nt-0.78□□□□□ -2.53
RPC10P40422 YER135CYER135C 393 nt-0.78□□□□□ -2.53
RPC10P40422 RPS20YHL015W 366 nt-0.78□□□□□ -2.53
RPC10P40422 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.78□□□□□ -2.53
RPC10P40422 PCF11YDR228C 1881 nt-0.78□□□□□ -2.53
RPC10P40422 GLG1YKR058W 1851 nt-0.78□□□□□ -2.53
RPC10P40422 RPF1YHR088W 888 nt-0.79□□□□□ -2.54
RPC10P40422 snR33snR33 183 nt-0.79□□□□□ -2.54
RPC10P40422 TIM13YGR181W 318 nt-0.8□□□□□ -2.54
RPC10P40422 YPT6YLR262C 648 nt-0.8□□□□□ -2.54
RPC10P40422 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.8□□□□□ -2.54
RPC10P40422 YBR099CYBR099C 384 nt-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 66.4 ms