Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB10P40306 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms