Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms