Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms