Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD1P28340 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD1P28340 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD1P28340 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLD1P28340 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD1P28340 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD1P28340 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD1P28340 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD1P28340 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD1P28340 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD1P28340 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD1P28340 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD1P28340 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD1P28340 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD1P28340 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD1P28340 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD1P28340 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD1P28340 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD1P28340 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD1P28340 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD1P28340 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD1P28340 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD1P28340 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD1P28340 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD1P28340 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD1P28340 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD1P28340 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD1P28340 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD1P28340 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD1P28340 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD1P28340 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD1P28340 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD1P28340 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD1P28340 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD1P28340 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD1P28340 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD1P28340 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD1P28340 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD1P28340 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD1P28340 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD1P28340 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLD1P28340 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLD1P28340 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLD1P28340 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLD1P28340 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLD1P28340 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms