Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms