Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms