Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms