Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms