Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD58P19256 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD58P19256 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD58P19256 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD58P19256 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD58P19256 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD58P19256 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD58P19256 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD58P19256 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD58P19256 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD58P19256 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD58P19256 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD58P19256 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD58P19256 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD58P19256 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD58P19256 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD58P19256 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD58P19256 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms