Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF3P18847 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF3P18847 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF3P18847 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF3P18847 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF3P18847 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF3P18847 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF3P18847 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF3P18847 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF3P18847 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF3P18847 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF3P18847 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF3P18847 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF3P18847 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF3P18847 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF3P18847 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF3P18847 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF3P18847 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF3P18847 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF3P18847 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF3P18847 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF3P18847 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF3P18847 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF3P18847 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF3P18847 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF3P18847 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF3P18847 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF3P18847 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF3P18847 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF3P18847 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF3P18847 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF3P18847 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF3P18847 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF3P18847 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF3P18847 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF3P18847 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF3P18847 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF3P18847 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF3P18847 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF3P18847 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF3P18847 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF3P18847 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms