Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN1P17600 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN1P17600 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN1P17600 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN1P17600 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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