Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms