Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms