Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALAP11233 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALAP11233 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RALAP11233 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RALAP11233 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RALAP11233 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RALAP11233 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RALAP11233 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALAP11233 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALAP11233 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RALAP11233 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RALAP11233 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RALAP11233 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALAP11233 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALAP11233 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALAP11233 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RALAP11233 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms