Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI4P10075 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI4P10075 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI4P10075 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI4P10075 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI4P10075 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI4P10075 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI4P10075 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI4P10075 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms