Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms