Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4AP0C0L4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms