Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP3A4P08684 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms