Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM2P07951 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM2P07951 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM2P07951 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPM2P07951 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPM2P07951 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPM2P07951 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM2P07951 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms