Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms