Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SOGA1O94964 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SOGA1O94964 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms