Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCNKO75909 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCNKO75909 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNKO75909 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNKO75909 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNKO75909 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms